اختلف المؤرخون في ضبط نسبه فمنهم من يرجع نسبه إلى قبيلة بني يفرن الأمازيغية، في جنوبي المغرب الأقصى. بدأ دراسة العلوم بمسقط رأسه بمراكش على جماعة من الأعيان كالشيخ أحمد بن علي المداسي المراكشي. ارتحل لطلب العلم بفاس في جامع القرويين حيث أخذ عن عدد من كبار العلماء، من أمثال: أحمد بن عبد الحيّ الحلبي و محمد ابن عبد الرحمن بن عبد القادر الفاسي . بعدما أنهى الافراني دراسته بفاس سنة (1130هـ/1717م)، عاد إلى موطنه مراكش، و بدأ التدريس بها، وكان يدرس العلوم الإسلامية عموما من تفسير و حديث و فقه. كما عمل إماماً وخطيباً في المسجد اليوسفي في مراكش.
لمحمد الصغير الإفراني تقاييد مفيدة ، و محاورات و رسائل و مقطعات شعرية . من مؤلفاته :
توفي بمراكش، في سنة اختلف المؤرخون عن تحديدها، وراوحت بين 1138هـ/ 1726 م و 1156هـ/ 1744 م . ودفن بالروضة التي قرب جامع ابن يوسف .